西历2059年，计划寻找新天地的银河移民船团“macross frontier”上，一名以不过作为通天巫之下的第一人，他的行为却也和通天巫相似，极少插手萨满教的具体事务而是一心潜修，最近几百年来更是极少露面，但作为可怕的威慑，无论听潮阁还是大阿修罗宗，却都不敢无视他的存在，不想他如今居然会不顾身「狴」份的出手偷袭蒙烈这么个小辈。驾驶员为目标而努力的少年早乙女阿尔特感受到了前所未有的闭塞感。这个时候，位于银河顶端的歌姬雪莉露·诺姆来到船团举行巡回演唱会，阿尔特以及憧憬着雪莉露的少女兰花·李当天都来到了会场。 然而演唱会当中，却突然遭到重机架生命体的袭击。为了保护少女们，阿尔特登上了最新型可变战斗机VF-25。在战火烽烟的尽头，传说中可以震撼宇宙的“歌”以及纠缠着少女们的“迷”究竟是什么……？
